Les cas d’utilisation de SD4Health vous permettent de sélectionner, d’analyser, de visualiser et de partager, de stocker ou d’archiver vos données en toute sécurité.
Bento
Bento est une plateforme flexible et open-source conçue pour simplifier la création et la gestion de portails de données génomiques. En adoptant des API et des schémas normalisés, Bento garantit une interopérabilité transparente avec diverses communautés de recherche dans le monde entier. Son architecture modulaire et ses composants réutilisables rationalisent le processus de développement, réduisant ainsi le temps et les efforts nécessaires à la création et à la maintenance des portails de distribution de données. Des projets réussis comme BQC19 et ICHANGE ont tiré parti des capacités de Bento pour créer des solutions de partage de données efficaces et efficientes.
GenPipes sur le calcul intensif dans le nuage
Les utilisateurs de SD4H peuvent demander des ressources informatiques avec GenPipes préinstallé. GenPipes est un gestionnaire de flux de travail polyvalent basé sur Python, créé au C3G et destiné à rationaliser la création et l’exécution de pipelines bioinformatiques multi-étapes adaptés aux clusters de calcul haute performance et aux environnements en nuage. Il comprend actuellement dix pipelines éprouvés et évolutifs pour diverses applications génomiques, telles que l’ARN-seq, le séquençage du génome entier (WGS), le séquençage de l’exome entier (WES), le ChIP-Seq et le séquençage d’amplicons.
Portail CQDG
Le portail du CQDG est une plateforme qui permet aux chercheurs d’accéder aux données génomiques du Centre de données génomiques du Québec. Il leur permet d’explorer, d’analyser et d’effectuer des analyses en ligne sur ces données. Le portail offre également un service d’informatique en nuage permettant aux chercheurs d’effectuer des analyses sur les ensembles de données du centre.
C3G
Le Centre canadien de génomique computationnelle (C3G) est un centre de bioinformatique de premier plan qui fournit des outils et des ressources informatiques de pointe aux chercheurs en sciences de la vie. Elle propose une large gamme de services, notamment l’analyse de données, le développement de logiciels et le calcul à haute performance. C3G joue un rôle crucial dans l’avancement de la recherche génomique en permettant aux scientifiques de traiter et d’analyser efficacement des ensembles de données biologiques à grande échelle. Son expertise et son infrastructure sont essentielles pour stimuler les découvertes dans des domaines tels que la médecine personnalisée, la génétique des maladies et le développement de médicaments.
Laval Services
A venir
Sherbrooke Services
A venir